在生物信息学领域，每一次探索都可能触及新的领域，每一次的合作都可能孕育出创新的火花。
为了促进生信领域的交流与合作，共建“开放、创新、合作、共赢”新生态，在中国计算机学会和广州实验室指导下，火山引擎和 Intel 联合发起 CCF 开源创新大赛暨第二届 Bio-OS 开源开放大赛。大赛以“开源共赢，科学无限”为宗旨，构建 Bio-OS 社区的开源生态。
11 月 12 日，CCF 开源创新大赛暨第二届 Bio-OS 开源开放大赛圆满落幕。本届大赛共有297支团队参赛。在激烈的决赛中，“乐想事成”团队在6支参赛队伍中脱颖而出，荣获“论文复现赛道”的冠军；“绿瓦生信”团队在5支参赛队伍中一马当先，夺取“任务挑战赛道”第一名；“抗体三次方”团队凭借实力，战胜了10支参赛队伍，在“AI 算法赛道”中摘得桂冠！
Bio-OS 开源开放大赛不仅是一场竞赛，更是一个集结智慧、激发创新、促进合作的交流平台，参赛者们不仅有机会展现自己的才智，还能与其他优秀人才交流思想、碰撞火花。那么本次参赛选手都有哪些收获呢？
群英荟萃，启迪生信创新灵感
本届大赛吸引了众多来自高校和企业的优秀选手，他们参与比赛的主要动力在于尝试运用理论知识、挑战自我，还有的选手则是与 Bio-OS 开源开放大赛不期而遇。
获得论文复现赛道一等奖的“乐想事成”团队和 AI 算法赛道二等奖的“Better++”团队均由高校学生组成，他们选择了与自己专业相关的赛道，想要尝试将理论知识应用于实践，以此增强实操技能。
有些选手则是因为偶然的机会与 Bio-OS 开源开放大赛结缘。AI 算法赛道一等奖的“抗体三次方”团队在网络平台上了解到了 Bio-OS 开源开放大赛，并被其挑战性所吸引，因此选择参赛；任务挑战赛二等奖的“崭晴生物”团队则是在第十届计算生物学大会 NCCBB 中，偶然与火山引擎的参展商进行交流后被鼓励参赛。
此外，也有选手是第二次参加比赛。陈哲名所在的“且行之队”获得了论文复现赛道三等奖，也是第二次参赛的选手，他表示参赛主要是为了克服自己的惰性，同时也想学习优秀作者的科研思路，而 Bio-OS 开源开放大赛正好提供了这一渠道和机会。论文复现赛道二等奖“碱基跳动”团队的陈宗贵同样也是第二次参赛，他表示去年参赛的成绩不理想，所以今年选择重振旗鼓。而在今年的比赛中，他发现 Bio-OS 平台新增了开发者模式，为构建流程的开发者提供了便利。
自我突破，将经验融入未来科研道路
本次大赛共有三个赛道，每个赛道都有不同的难点。而选手们不仅克服了赛道中的难点，还克服了时间紧、工作与比赛冲突、不了解 Bio-OS 平台等难题，实现了自我突破。
在论文复现赛道中，理解论文的核心思路并补充缺失的代码对于参赛选手来说是最大的挑战。“且行之队”和“碱基跳动”团队认为，论文提供的源代码非常有限，所以需要根据花费大量的时间和精力理解文章。然而，在克服这一困难后，选手们发现自己不仅学习了顶尖作者的科研思路和经验，对工作或学习有帮助，还增强了对标准化和平台化的认识。
任务挑战赛需要参赛团队打造集成生物信息分析的智慧应用。开发应用则需要开发者以用户需求和体验为先，重视工作流程的搭建和操作文档的编写，从而提高应用的可用性。“崭晴生物”团队在比赛中意识到了这一点，他们致力于构建以用户体验为先的工作流程。这一策略不仅帮助他们在比赛中取得了优秀的成绩，也让他们学会了如何在未来的工作中更有效地满足用户需求，提供更优质的服务。
除了与时间赛跑和攻克赛题的难点，团队合作同样是取胜的关键因素之一。实际上，团队间的协作比单个成员的能力更为关键，这要求每位成员不仅要发挥自己的专长，还要相互支持，携手面对挑战，共同克服困难。“乐想事成”团队和“抗体三次方”团队正是掌握了这一诀窍，使得团队分别荣获论文复现赛道和 AI 算法赛道的一等奖。
指导老师的帮助对于他们来说也同样重要。“乐想事成”团队的指导老师是杜萌泽，杜萌泽老师在整个暑假期间监督团队打卡和汇报进度，同时指出问题并提供指导。“抗体三次方”团队则表示，随着模型变得越来越大，算力成为了一个瓶颈。为了鼓励和支持他们参加比赛，北京协和医院为他们提供了高性能计算平台，北京协和医学院的王晓月教授也给予了宝贵的帮助和专业的指导。
Bio-OS 平台赋能，点亮科研道路的新火花
Bio-OS 平台在本次大赛中扮演了核心的支撑角色，为参赛选手带来了诸多便利。参赛者普遍对 Bio-OS 平台的使用体验给予了积极的评价，他们认为 Bio-OS 平台不仅在比赛过程中发挥了重要作用，而且对生信领域的科研活动也具有深远的意义。
“且行之队”“乐想事成”和“碱基跳动”团队认为，Bio-OS 平台的流畅性、稳定性以及资源调用的灵活性对于比赛有很大的帮助。在处理大量数据时，Bio-OS 平台能够在保障稳定和流畅的同时，根据数据处理的不同阶段灵活调整资源配置，在参数设置上也能为用户提供的多样化选择，为大规模数据处理提供了有力支持。此外，Bio-OS 平台开源开放的特性对科研知识共享和传播也具有重要意义，有助于推动科学界的知识公开和研究透明度。
而“抗体三次方”“Better++”和“崭晴生物”团队表示，Bio-OS 平台是面向大众、使用门槛低的平台，它能够封装分析流程，让不会编程的生物科学家快速上手复杂的分析工作，更无需关注运行环境、 Bug 等细节问题，从而大大降低科研工作的时间成本，提高科研效率。
在科研领域进入第五范式后，人工智能的应用变得愈发重要。在本次比赛中，“崭晴生物”团队利用了 Bio-OS 平台链接的豆包大模型进行了生物学功能的注释，为团队提供了参考结果。他们认为，这只是大模型应用在生信领域的初步阶段，随着大模型的进一步迭代，未来或许可以在大模型中内置参数设置和用户交互，实现代码的自动生成和输出，从而更好地实现可视化，帮助用户选择最佳的分析路径，优化工作流程。
CCF 开源创新大赛暨第二届 Bio-OS 开源开放大赛的圆满落幕让我们共同见证了科技与生物信息的碰撞，更感受到了生物信息学领域未来发展的强劲脉搏。每一位参赛者，每一个参赛团队，都在比赛中收获了宝贵的经验，也推动了 Bio-OS 平台在 AI4S 领域的应用。
