卵巢癌是影响女性生殖系统的最具挑战性的癌症之一，其中高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)是最致命的。与许多其他类型的癌症一样，这种类型的癌症不是由单一突变驱动的，这使得它更难治疗，正因为如此，由理研高级智能项目中心(AIP)和日本国家癌症中心研究所的Hidnowi Machino领导的研究人员没有研究DNA序列，而是专注于表观遗传学特征——特定细胞类型中影响基因表达的开/关开关，在这种情况下，它会导致肿瘤形成。
HGSOC起源于输卵管，最困难的病例是对化疗无反应。研究人员使用来自人输卵管上皮细胞的细胞瞄准了这种类型的肿瘤，他们在不同的条件下生长，并使用特殊的综合组学分析进行研究。
Machino说：“这项分析集成并分析了来自多种高通量技术的海量数据，包括ATAC、芯片和RNA测序，以获得对复杂生物系统的整体理解。”
这项多组学分析预测，当细胞从正常转变为癌症时，控制基因表达的特定因素在肿瘤发生过程中表现异常，这些预测是通过比较正常细胞和癌细胞之间的蛋白质水平来检验的。
预测成立，研究人员发现，某些蛋白质，即AP-1复合体，在癌细胞中过度活跃，这些蛋白质在刺激癌细胞的生长和扩散方面发挥了作用。此外，另一组蛋白质，GATA家族，通常有助于控制细胞行为，被发现在癌细胞中效果较差。
分析还确定了在控制癌症生长方面发挥关键作用的特定基因-MAF、GATA6和DAB2。在肿瘤发生的早期，这些基因在表观遗传上受到抑制，导致肿瘤的形成。通过了解抑制这些基因是如何导致功能障碍的，研究人员能够推断出一种对策。
“我们意识到罪魁祸首是表观基因抑制导致的RAS过度激活，”Machino说，“并推断一种可以阻断这一途径的药物将逆转这一趋势。”
当用曲美替尼进行测试时，他们观察到了正常表观遗传控制的迹象，包括MAF和DAB2的解除抑制。曲美替尼是一种临床适用的药物，可以抑制RAS信号。
像曲美替尼这样的药物被称为MEK抑制剂，这项研究预测，它们可能在预防卵巢癌的肿瘤形成方面有效。此外，被抑制的MAF、GATA6和DAB2可能是有用的生物标志物。
“我们发现的HGSOC生物标记物有可能用于卵巢癌的早期检测，”Machino说，“这些发现还指出了新的治疗方法，这可能会对社会产生重大影响。”
