除了可能发生的大规模计算资源的系统故障外，云服务器安全隐患还包括缺乏统一的安全标准、适用法规以及对于用户的隐私保护、数据主权、迁移、传输、安全、灾备等问题。
云安全从性质上可以分为两大类，一类是用户的数据隐私保护，另一类是针对传统互联网和硬件设备的安全。
在技术安全方面，首先是多租户带来的安全问题。不同用户之间相互隔离，避免相互影响。云时代，需要通过一些技术防治用户有意或无意识地"串门"。云端作为云服务提供商，自主研发的果云主机，在云计算的应用模式下，黑客将束手无策，找不到攻击的精确目标，因为他不知道数据存储和传输的精确位置，更何况不论存储还是传输均具有最高级加密机制，就像我们用电，不知道是哪个发电站发的电。
其次，采用第三方平台带来的安全风险问题。提供云服务的厂商不是全部拥有自己的数据中心，一旦租用第三方的云平台，那么这里面就存在服务提供商管理人员权限的问题。
第三，服务连续性问题。传统互联网服务也存在单点故障的问题，所以，才会有双机备份：主服务器停止服务，备用服务器在短时间内启动并提供正常服务。WOS云平台具有高安全性与开放性特点，采用基于WS-SECUTITY安全标准的Web service，保证了高安全性，使平台API安全的暴露在Internet中，供各供应商安全自由调用。这个安全标准是基于ISO标准，也保证了可扩展性与异构平台的统一性，只要所有的设计者都基于同一个国际标准，即可实现互通与异构。
在传统方式下，一组服务停止工作只会影响到自己的业务和用户，但是在云环境下，云服务提供商的服务终止了，影响的就不是一个用户，而是一大片用户，范围可能非常巨大。
中国的云计算产业发展必须在数据迁移、备份、加密以及位置控制方面进行深入的研究，保证云服务的易用性、可用性、稳定性、安全性等。安全问题的解决还包括云计算相关法律法规的不断完善，增强用户使用云计算的信心。除了技术问题之外，用户自我保护的意识也必须加强。虽然，现在逐渐有各种安全措施加以保护，甚至未来还将不断推出完善的法律法规，但是最终数据的安全与否很大程度还是掌握在用户手中。
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