由于定位于WS工作站级主板而非顶级游戏系列,华硕Z7S WS和Skulltrail的设计理念有些区别,虽然同样使用Intel 5400芯片组,支持双路LGA 771处理器,但Z7S WS没有使用NVIDIA的MCP芯片,因此无法对SLI提供支持,仅能实现Crossfire。另外,它和D5400XS的区别还包括,拥有六条FB-DIMM内存插槽(D5400XS为4条),三条PCI-E x16插槽,两条为PCI-E 2.0 x16,一条为PCI-E 1.1并且仅有8x带宽。另外,它的扩展槽还包括一条PCI-E x1,一条PCI-X和一条PCI 2.2,用来支持工作站专业及应用。
华硕Z7S WS的散热系统也经过了华硕的特别设计,专门为内存插槽提供了主动散热系统。另外,其CPU散热设计仅能支持Xeon处理器专用的LGA 771散热器,而不能像Intel X5400XS主板一样支持普通LGA 775散热器。
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