传统的扫描仪是采用CCD技术，CCD技术的扫描仪工作原理：采用冷阴极管发光，图像信号经二至三个反射镜反射后用CCD接收变为电信号。CIS技术的扫描仪是一种新的扫描技术，发光体是用LED排，并且不经过反射镜反射，通过导光管直接被多芯片传感器接收，即以一点一点（DotbyDot)方式扫描。
二者的不同之处有：
CCD技术的扫描仪因为其发光体是冷阴极管（类似日光灯管），耗电量大而且寿命相对短，容易受到外力的影响而发生断裂，优点是扫描质量好，景深好；CIS技术的扫描仪用的LED（发光二极管），此种发光体没有CCD的缺点，LED发光的亮度合适（此特点被业内人称之为“不发光的扫描仪”），缺点是扫描质量较差，景深浅。
CCD扫描仪接收信号要经过二到三个反射镜将光信号送到光电耦合器，当反射镜的安装位置稍有偏差就会直接影响到扫描效果，而且光信号的失真度同反射镜有很大的关系；CIS技术的扫描仪用点对点接收，不用任何的反射设备，失真度更小，但有些一致性问题。
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