Ubuntu长时间的发展已经被各种的相同系统的开发仇视这，Debian系统与UbuntuUbuntu对Debian系统的依赖依然非常严重，但是它们之间的关系却并非总是那么和睦。
Ubuntu与Debian系统的冲突
在很多方面，Ubuntu对Debian系统的依赖依然非常严重，但是它们之间的关系却并非总是那么和睦。Ubuntu的成功使其与Debian系统的关系开始变得紧张，人们指责Ubuntu是寄生虫，没有对Debian系统作出等价的回报。在过去数年中，Ubuntu社区已经采取了重要的措施来缓解这种紧张关系，解决两者之间的冲突。
在2005年两者之间的争论***次出现，Debian系统创始人Ian Murdock表示，Debian系统和Ubuntu要想实现双赢，需要保持这两个Linux版本之间的兼容性和互通性。
他表示，“如果Ubuntu是Debian系统家庭中的一员，它的成功就代表着Debian系统家庭的成功。但是，前提是Ubuntu还是Debian系统家族的好儿子。我的担心是，它正在显现出变为任性孩子的迹象，早期的成功使其变得自大，开始怀疑自己是否还需要它的父亲。如果Debian系统能从Ubuntu中获益，两者之间的血脉将得以延续，Ubuntu必须更强大，而不是简单的模仿Debian系统。”
Shuttleworth对Murdock的大部分观点表示赞同，强调协作是两者向前发展的***道路。
Shuttleworth在几年前表示，“我认为，没有Debian系统就没有Ubuntu。因此我认为Ubuntu是Debian系统一个扩展产品，Ubuntu有责任和义务推动Debian系统的发展，因为Ubuntu的成功是因为站在伟大Debian系统的肩膀上。”
但是，它们两个在几个关键技术问题上存在意见分歧，例如在解决互操作性问题上两者就有不同的观点。Murdock在DCC联盟担任要职，该组织由Debian系统和几个衍生Linux联合创建，旨在为Debian系统创建一个兼容LSB的共同核心。Murdock希望这样可以保证所有基于Debian系统的Linux系统之间的兼容，防止发生他所担心的各自为政的现象。该计划在几个层面上都存在失误之处，其技术上的失败最终导致了它的瓦解。Shuttleworth曾准确的预言了这些问题，并且没有遵循DCC标准。
曾经有几个活动来让这两个社区增加协作，但是这些活动一直未取得较大成功。在Debian系统方面，建立了Utnubu项目来帮助将Ubuntu软件包加入到Debian系统中。在Ubuntu方面，则创建了Debian系统协作团队(DCT)来实现类似的目标。这两个项目都没有取得重大进展，但是它们也显示了双方希望加强合作的意愿。
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