希望我对Visual Studio 2003 Web的一点经验能给大家带来帮助，导致WebDeployment出错的原因也许还有很多，不过在你遇到错误时，可以先检查一下你程序中的字符串，暂时把他们置为””,试试看。没准就是他引起的问题啊。
解决方案一：
1.确定有安装.net framework 1.1，可以查看目录，c:\winnt\microsoft.net\framework重启IIS，重启计算机（常规纠错方法）
2.如果你的Web服务器使用了固定IP：确定你的“Internet信息服务”中使用的是“默认web站点”并且属性中的IP地址为“（全部未分配）”，不是指定IP地址。不要删除默认web站点，如果删除了，也可以新建一个名称为“默认web站点”的目录。
3.如果IE使用了代理，“对于本地地址不使用代理服务器”勾上。
4.配置问题，从windows的“开始”菜单->程序->Visual Studio .NET 2003->Visual Studio .net 工具->Visual Studio .net命令提示，打开窗口，输入aspnet_regiis /i，稍等片刻，提示开始安装，结束安装，回到提示符下。
5.重装IIS。重装之后也要进行步骤4。 #t#
解决方案二：
"Visual Studio .NET已检测到指定的Web服务器运行的不是ASP.NET 1.1 版..."的解决办法 选择自 great_domino 的 Blog
关键字 "Visual Studio 2003 Web已检测到指定的Web服务器运行的不是ASP.NET 1.1 版..."的解决办法
出处
昨天同事MM在调试一台装有.NET WEB服务器又出现了"Visual Studio .NET已检测到指定的Web服务器运行的不是ASP.NET 1.1 版.."的错误，叫我去帮忙搞，搞了半天，才搞定，到底是什么问题
原来她将IIS中“默认web站点”删除，自己新建了一个站点，运行正常，就是无法编译，新建也不成，出现非1.1版本错误，以前出现错误是因为，服务器使用了固定IP，而管理员将属性中的IP地址为指定的ip地址！现在也很有必要做个总结！
Visual Studio 2003 Web步骤尝试如下：
1.当然先确定一下，是否真的装了1.1的版本，查看路径 C:\WINNT\Microsoft.NET\Framework\v1.1.4322
2.也是很多人都知道，重新安装 aspnet_regiis ，怎么安装，就不多说了，网上很多！
3.重启IIS，重新启动ASP.NET服务程序
4.如果你的Web服务器使用了固定IP：确定你的“Internet信息服务”中使用的是“默认web站点”并且其属性中的IP地址为“（全部未分配）”，而不是你己指定的ip地址。可以修改“默认web站点”的名字，但不要删除，一旦删除，只要在新建的时候，名称严格为“默认web站点”也可以恢复
5.如果你的IE使用了代理的话，把 Bypass Proxy Server for local adresses勾上
6.如果你本身已经有个Visual Studio 2003 Web站点，请把它卸载掉，不用重新安装vs.net，只要重新安装下iis也可以。
7.如果还是不行，那可真没什么办法了，那就重装IIS，FRAMWORK，.NET，操作系统吧
最后说一个安全问题，尽量不要把IIS指向默认路径C:\Inetpub\wwwroot 这个路径很容易受攻击，最好重新指向一个新的路径，然后把wwwroot文件夹删除掉，需要用户上传文件的，千万要阻止上传“.HTA”文件，做好访问网站的权限，屏蔽执行HTA文件，做好数据库备份工作！
又是工作中的一点经验，供大家参考，少走弯路！
